首先被核实的肯定是离京师最近的蓟镇，高耀根据御史会同蓟辽总督唐顺之核实各军人数之后的数据，更定蓟州密云昌平三镇应发本年客兵钱粮之数，蓟州镇银二十七万六千一百二十两、密云十九万七千四百十两、昌平六万四千一百一十八两，比之以往减少了数万两。
同时，徐阶不但整顿九边，还派出御史整顿京营，清理冒滥和占役，稽核军饷、军器，奉徐阶之令巡视京营的工科给事中辛自修巡视完毕之后上疏：请将军器兵仗二局所造盔甲火器俱付巡视衙门及本部官督理。
这下可算是捅了马蜂窝，御史们整顿京营、整顿九边这都算说得过去的事情，可是兵仗局可是内廷衙门，什么时候轮到外廷御史来监察了，兵仗局的掌印太监当即跑到老祖宗黄锦面前哭诉去了，黄锦也觉得这事不妥，御史的手再长，总不能伸进内廷来吧？
但是黄锦知道，这个辛自修可不好惹，也是科道言官中的刺头，从担任御史起就接连弹劾高官，战果辉煌，巡视京营以来，弹劾典营务镇远侯顾寰、协理佥都御史、兵部左侍郎郑晓，请求警告顾寰，罢免郑晓，在徐阶的支持下，郑晓在这次京察时被罢免。
若是仅仅弹劾勋臣和大员，辛自修最（本章未完，请翻页）
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